Nahlásiť chybu v článku
Občas sa niekde objaví nejaká chybná informácia, preklep, či nesprávna interpretácia. Budeme radi, ak nás na túto chybu cez tento formulár upozorníte, aby sme ju mohli čo najskôr opraviť. Redakcia TASR.sk
TASR, 12. mája 2021 15:14
Spoločnosť Zymo Research sprístupňuje zdroj bioinformatických informácií na detekciu variantov SARS-CoV-2 v odpadových vodách
Včasné sprístupnenie zdroja bioinformatických informácií VirSieve™ podporí spoluprácu pri výskume vplyvov SARS-CoV-2 na životné prostredie.
Irvine 12. mája (TASR/OTS/PRNewswire) - Spoločnosť Zymo Research sprístupnila zdrojový kód k zdroju bioinformatických informácií VirSieve ™ komunite zaoberajúcej sa mikrobiológiou životného prostredia s cieľom podporiť celosvetovú spoluprácu a detekciu variantov SARS-CoV-2 v odpadových vodách.
VirSieve™ je automatizovaný výpočtový kanál, ktorý analyzuje sekvenčné čítania z vírusu SARS-CoV-2 vo vzorkách odpadových vôd na lepšie porozumenie vírusovým variantom prítomným v monitorovaných komunitách.
Hodnotením intervalu spoľahlivosti pozorovaných vírusových mutácií má softvér potenciál významne zvýšiť presnosť analýzy akýchkoľvek zmien vírusového genetického materiálu.
Podľa Centra pre kontrolu a prevenciu chorôb malo zavedenie vakcín obrovský pozitívny vplyv na potlačenie pandémie SARS-CoV-2 v USA, no napriek tomu sa stále objavujú nové vírusové kmene. Niektoré z týchto kmeňov, napr. B.1.1.7, sú klasifikované ako tzv. varianty vzbudzujúce obavy z dôvodu dôkazov o zvýšenom šírení, patogenite alebo úniku vakcíny. Sekvenovanie odpadových vôd novej generácie sa ukazuje ako najschodnejšie riešenie pre dohľad nad komunitou v reálnom čase.
Vírusové sekvenovanie z odpadových vôd je náročné z dôvodu fragmentácie a degradácie vírusovej RNA, čo často vedie k chybám v sekvenovaní, ktoré sa nakoniec prejavia ako falošné mutácie. VirSieve™ dokáže identifikovať tieto falošné varianty a označiť ich za slabé alebo nespoľahlivé, čo umožňuje výskumníkom filtrovať mutácie s vyšším stupňom podpory. Zymo Research tiež poskytuje činidlo DNA/RNA Shield™, ktoré chráni vírusovú RNA pred ďalšou degradáciou po inaktivácii vírusu pre bezpečný odber a prepravu vzoriek odpadových vôd pri izbovej teplote.
"Spoločnosť Zymo Research už predtým vyvinula verejné softvérové nástroje, ako je Zymo Research Transmit Program, klient s otvoreným zdrojom na odosielanie výsledkov testov COVID-19 prostredníctvom systému hlásenia verejného zdravia CalREDIE," uviedol riaditeľ laboratórnych informačných systémov a vedúci projektu VirSieve™ Pipeline v spoločnosti Zymo Research Dr. Michael Weinstein.
"VirSieve™ je súčasťou neustáleho úsilia spoločnosti Zymo Research poskytovať maximálnu podporu snahám riešiť celosvetovú pandémiu. Cítime, že VirSieve ™ má potenciál byť použitý nielen na sledovanie variantných kmeňov vírusu SARS-CoV-2 v odpadových vodách, ale aj iných vírusov v budúcom úsilí v oblasti verejného zdravia."
"Získanie presných variantov z klinických vzoriek alebo splaškových vôd je kľúčom k správnemu umiestneniu vírusového kmeňa v kontexte všetkých ostatných vírusových variantov a informovania o úsilí sledovať patogény," uviedol Dr. Christopher Mason, ktorý je plateným rečníkom spoločnosti Zymo Research a spoluriaditeľom inštitútu WorldQuant pre kvantitatívnu predpoveď, ako aj profesorom fyziológie a biofyziky na inštitúte Weill Cornell Medicine.
Viac informácií o nástroji VirSieve™ nájdete na webových stránkach spoločnosti Zymo Research alebo ju môžete kontaktovať e-mailom na adrese tech@zymoresearch.com.
O spoločnosti Zymo Research Corp.
Zymo Research je súkromná spoločnosť, ktorá už od roku 1994 slúži vedeckej a diagnostickej komunite pomocou najmodernejších nástrojov molekulárnej biológie. Jej motto "Krása vedy spočíva v uľahčovaní vecí" sa odráža vo všetkých jej produktoch, a to od epigenetiky až po technológie čistenia DNA/RNA.
Spoločnosť Zymo Research, ktorá je historicky uznávaná ako líder v oblasti epigenetiky, prekonáva hranice pomocou nových riešení pre odber vzoriek, mikrobiomické merania, diagnostické prístroje a technológie NGS, ktoré sú vysoko kvalitné a ľahko použiteľné. Sledujte Zymo Research na Facebooku, LinkedIn, Twitteri alebo Instagrame.
Ďalšie informácie o produktoch od spoločnosti Zymo Research týkajúcich sa COVID-19 nájdete na nasledujúcich odkazoch:
Zymo Research sprístupnila bezplatný softvér na zefektívnenie reportovania testov COVID-19
Spoločnosť Zymo Research získala označenie CE IVD na prípravok Quick SARS-CoV-2 Multiplex Kit
Zymo Research získala od FDA povolenie na núdzové použitie prípravku Quick SARS-CoV-2 rRT-PCR
Spoločnosť Zymo Research získala označenie CE IVD na prípravok Quick-DNA/RNA™ Viral MagBead Kit
Spoločnosť Zymo Research sprístupnila sekvenačnú službu COVID-19 na detekciu a dohľad nad vznikajúcimi variantmi SARS-CoV-2
Spoločnosť Zymo Research ponúka detekciu a sledovanie variantov v celej komunite prostredníctvom služby testovania odpadových vôd Environ™ COVID-19.
Spoločnosť Zymo Research získala 510 tisíc dolárov za zariadenie na zber/prepravu pre COVID-19
Foto - https://mma.prnewswire.com/media/1507133/Wastewater_PR_data_on_computer_2000x1111px.jpg
Logo - https://mma.prnewswire.com/media/364743/Zymo_Research_Corp_Logo.jpg
KONTAKT:
Marketingové oddelenie
Zymo Research Corp.
949.679.1190
marketing@zymoresearch.com
Upozornenie: Upozorňujeme odberateľov, že materiály označené skratkou OTS sú poskytované v rámci Originálnej textovej služby a za ich obsah nesie zodpovednosť zadávateľ.