Nahlásiť chybu v článku
Občas sa niekde objaví nejaká chybná informácia, preklep, či nesprávna interpretácia. Budeme radi, ak nás na túto chybu cez tento formulár upozorníte, aby sme ju mohli čo najskôr opraviť. Redakcia TASR.sk
TASR, 11. augusta 2017 16:14
Spoločnosť Swift ponúka metódu prípravy knižnice s najvyššou priepustnosťou na báze metylačného bunkového sekvencovania
Štúdia publikovaná v časopise Science demonštruje, ako dokážu epigenetické markery identifikovať bunkové podtypy a regulačné prvky, ktoré stoja v pozadí rôznorodosti buniek.
Ann Arbor 11. augusta (TASR/OTS/PRNewswire) - Spoločnosť Swift Biosciences, popredný poskytovateľ inovatívnych riešení na prípravu knižníc pre sekvencovanie novej generácie (NGS), dnes oznámila spustenie novej metódy metylačného bunkového sekvencovania pomocou technológie Accel-NGS® Adaptase™, efektívneho a robustného NGS-prípravného riešenia pre bisulfitové sekvencovanie celého genómu pri rozlíšení na úrovni bunky. Táto nová metóda umožňuje efektívnu analýzu rôznych metylovaných oblastí v tisícoch buniek z heterogénnych tkanív, ako aj klasifikáciu buniek, reguláciu bunkových mechanizmov v normálnom tkanive, epigenetické zmeny v chorobných stavoch a evolučnú ochranu epigenomickej regulácie.
Metylácia je stabilný biomarker použiteľný na identifikáciu bunkových typov a regulačných prvkov, ktoré sú základom bunkovej funkcie. Keď sa spojí so štúdiami bunkovej expresie RNA, metylácia bunky môže objasniť regulačné prvky, a tak riadiť jedinečné profily expresie jednotlivých buniek a rozdiely medzi bunkami. Navyše nedávne klinické štúdie odhalili spôsoby metylácie pri ochoreniach, ako je rakovina, ktoré identifikujú typ nádoru, hodnotia nádorové zaťaženie v tekutých biopsiách a korelujú ho s progresiou ochorenia, prognózou a reakciou na liečbu.
Táto metóda bola nedávno opísaná v článku v časopise Science s názvom "Bunkové metylómy identifikujú neurónové podtypy a regulačné prvky v mozgovej kôre cicavcov" kolektívom odborníkov zo Salk Institute Kalifornskej univerzity v San Diegu a Swift Biosciences. Pracovný postup spája izoláciu založenú na triedení na báze fluorescencie, konverziu bisulfitu a modul Swift Accel-NGS Adaptase s inými komerčne dostupnými komponentmi. Publikované výsledky preukázali viac ako dvojnásobný nárast miery mapovania a čítania v porovnaní s inými metódami, čím sa výrazne zvyšuje kvalita výstupných dát na jednu sekvenciu a znižujú celkové náklady.
"Jedná sa o jednu z mnohých vedeckých prác, v ktorej spoločnosť Swift technológie posúva hranice vedy," povedal Timothy Harkins, prezident a generálny riaditeľ spoločnosti Swift Biosciences a spoluautor článku. "Sme nadšení z nových poznatkov o základných bunkových procesoch a z vyhliadok, ktoré má táto technológia v rámci budúcnosti presných lekárskych postupov."
"Naša vlastná technológia Adaptase konštruuje sofistikované NGS knižnice z jednovláknových DNA s nízkym vstupným množstvom," povedala Laurie Kuriharová, PhD, vedúca pracoviska výskumu a vývoja a spoluautorka článku. "Náš postup pri práci s bunkou obsahuje menej krokov než iné metódy a ponúka viacnásobné spracovanie jedinej bunky, ktoré poskytuje vyššiu produktivitu pre aplikácie s vysokou priepustnosťou."
Modul Accel-NGS Adaptase je teraz komerčne dostupný.
KONTAKT: Darby Wagner, Lambert, Edwards & Associates, (616) 258-5779, dwagner@lambert-edwards.com
UPOZORNENIE: Upozorňujeme odberateľov, že materiály označené skratkou OTS sú poskytované v rámci Originálnej textovej služby a za ich obsah nesie zodpovednosť zadávateľ.
TASR/OTS svi